The Grid zoekt naar vaccin tegen vogelgriep

Analyse van 30.000 componenten

05 mei 2006 | Remco Mourits Een grid computing project, dat is ontwikkeld voor natuurwetenschappelijk onderzoek, wordt ingezet in een internationale poging een medicijn voor het vogelgriepvirus H5N1 te ontwikkelen.

Bij grid computing worden high-end computersystemen, netwerken, databases en wetenschappelijke apparatuur die eigendom zijn van diverse organisaties samengevoegd, onder andere om meer rekenkracht te genereren.

De Britse Particle Physics and Astronomy Research Council (PPARC) had samen met enkele Aziatische wetenschappelijke organisaties zo'n grid opgezet. Doel was datatabase-onderzoek naar elementaire deeltjes. Het grid is echter tijdelijk ingezet om te zoeken naar bestandsdelen van medicijnen die zouden kunnen worden gebruikt in de strijd tegen H5N1, beter bekend als de vogelgriep.

Deze heeft flink veel huisgehouden in de vogelpopulatie van Azië en Europa, en wetenschappers vrezen dat het via mutaties uiteindelijk ook tot een epidemie onder de menselijke bevolking zal kunnen leiden.

De internationale samenwerking, simpelweg The Grid genoemd, combineert ongeveer tweeduizend computers uit diverse laboratoria. In april hebben ze 30.000 verschillende componenten geanalyseerd voor een potentieel vaccin.

Voor de rekenkracht die gedurende vier weken werd aangesproken, zou een gewone pc honderd jaar moeten draaien. De applicatie creëerde meer dan 60.000 bestanden met een totale omvang van 600 GB.

Met een bijdrage van Stefanie Olsen, CNet Lees meer artikels over : vogelgriep, grid, onderzoek, supercomputer

bron: ZDNet